Bioinformatics Research Group at Universidad del Valle

Ana Karina Velez, Irene Tischer (2011). PDS (Protein Data Selector) Registro (Radicación): 1-2011-40988. Agosto, 2011. Dirección Nacional Derechos del Autor. Colombia.
Description: Seleccionar datos proteicos de intenet, con criterios restringidos por el usuario

Nestor Milciades Diaz, Irene Tischer (2011). Framework computacional para el diseño inverso de modelos de automata celular a partir de trayectorias de plegamiento de proteina Registro: 13-29-418. Agosto, 2011. Dirección Nacional Derechos del Autor. Colombia.

Adrian Lasso, Kenny Rodriguez, Irene Tischer (2011). Simulador de código genético usado en la expresión de proteínas, en cuanto a su capacidad de minimizar los efectos causados por mutaciones genéticas, usando simulación y procesos de modelación. Registro: 13-29-424. Agosto, 2011. Dirección Nacional Derechos del Autor. Colombia.
Description: Una herramienta desarrollada en java, que nos ayuda a analizar el código genético universal.

Margot Cuaran, Irene Tischer (2011). MIMO: Modelo para Identificación de Motivos Cis-reguladores en secuencias ADN Eucariotas. Registro: 13-29-190. Mayo, 2011. Dirección Nacional Derechos del Autor. Colombia.
Description: MIMO es un software que emplea un modelo probabilístico que combina los modelos ocultos de markov con probabilidad de distribución multiespacial y los generalizados. los elementos del promotor como la caja tata, caat y gc se identifican alrededor del sitio de comienzo de la transcripción de adn, mediante información estadística provista por el método de matrices de peso.

Luis Garreta, Irene Tischer (2011). Interfaz Gráfica de Usuario para entrenamiento, predicción y visualización de genes. Registro: 13-29-189. Agosto, 2011. Dirección Nacional Derechos del Autor. Colombia.

Luis Garreta, Irene Tischer (2011). Uso de fuentes externas bioinformaticas para retroalimentar la etapa de prediccion de un buscador de genes. Registro: 13-29-406. Mayo, 2011. Dirección Nacional Derechos del Autor. Colombia.

Hector Espitia, Pedro Moreno, Irene Tischer (2011). Genomamf. Registro: 13-28-383. Abril, 2011. Dirección Nacional Derechos del Autor. Colombia.
Description: Software de bioinformática para el análisis multifractal en secuencias de adn y proteínas. permite determinar, discriminar y comparar regiones de genomas con alto con contenido de información genética de regiones con bajo contenido de información genética de manera automatizada.

Mauricio Ciprián, Pedro A. Moreno, Irene Tischer (2011). Software para el ensamblaje y alineamiento de secuencias metagenomicas de manera distribuida usando computación pública o voluntaria. Registro: 13-28-352. Marzo, 2011. Dirección Nacional Derechos del Autor. Colombia.

Nilson Mossos (2011). FINDRELATION2SEQ: Find relation between sequence's pairs. Registro: 13-28-323. Marzo, 2011. Dirección Nacional Derechos del Autor. Colombia.
Description: Findrelation2seq (del ingles find relation between sequence's pairs) es una herramienta de software que permite identificar relaciones entre pares de secuencias (x; y ), donde x son secuencias sobre un alfabeto 1 y y son secuencias sobre un alfabeto 2. Estas relaciones son expresada como una regla p ⇒ q, que se leen como p (antecedente) deriva a q(consecuente). p es una subsecuencia sobre el alfabeto 1 y q una subsecuencia sobre el alfabeto 2.

Oscar Restrepo (2011). Software para la extracción, transformación, almacenamiento y visualización de los datos genómicos alrededor de los sitios de integración de los retrovirus en el genoma humano. Registro: 13-24-216. Marzo, 2011. Dirección Nacional Derechos del Autor. Colombia.
Description: El software es una aplicación web desarrollada en el lenguaje de programación java y que usa una base de datos postgres para la extracción, transformación, almacenamiento y visualización de los datos genómicos alrededor de los sitios de integración de los retrovirus en el genoma humano.

Hernan David Ramirez, David Molina, Irene Tischer (2011). Aplicación para la determinación de las proteínas donde el TAX de un retrovirus puede acloparse. Registro: 13-28-330. Marzo, 2011. Dirección Nacional Derechos del Autor. Colombia.
Description: Software to determine a possible interaction between the TAX of a retrovirus and proteins, based on public databases and a ligand-proteín simulation.

Mauricio Martinez, Irene Tischer (2011). Dinámica molecular incremental para la generación de configuraciones iniciales en la predicción de plegamiento de proteínas. Registro: 13-28-330. Marzo, 2011. Dirección Nacional Derechos del Autor. Colombia.
Description: Implementación de un producto software donde se aplica el método de dinámica molecular incremental (diseñado por los autores) por medio del cual se busca generar configuraciones iniciales cercanas a las que tiene la proteína en su estado nativo y de esta manera hacer mas eficiente el proceso de predicción de estructura secundaria.