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-<DOCUMENT filename="C1_HistoriaBiologiaMolecular_Actualizada_2025.pdf">
-Total pages: 95
-<PAGE 1> Biología Molecular – Genómica
-Bioinformática y Ciencias Ómicas
-Pedro A. Moreno
-Escuela de Ingeniería de Sistemas y Computación
-Facultad de Ingenierías - Universidad del Valle
-Cali, COLOMBIA
- </PAGE>
-<PAGE 2> Bioinformática
-Biología
-Las Ciencias de
-la Computación
-La Tecnología de
-la Información
-Matemáticas                                 Estadística
- </PAGE>
-<PAGE 3> Tres sub-disciplinas dentro
-de la Bioinformática
-) Desarrollo de nuevos algoritmos, estadísticas y
-bases de datos para evaluar las relaciones entre un
-gran número de datos.
-) El análisis y la interpretación de datos que incluyen
-secuencias de nucleótidos y aminoácidos, dominios de
-proteínas y estructuras de proteínas.
-) El desarrollo e implementación de herramientas
-que
-proporcionan acceso eficiente y manejo de los
-diferentes tipos de información.
- </PAGE>
-<PAGE 4> Requerimientos ¨core¨ para los
-bioinformáticos
-) Conocimiento en algunos aspectos de la biología molecular.
-) Entender perfectamente el dogma central de la biología
-molecular.
-) Debería tener alguna experiencia substancial en uno o dos
-de los grandes paquetes de programas de biología molecular.
-) Debería trabajar confortablemente en medio ambiente de
-computación de comandos de líneas, como Linux o Unix.
-) Debería tener experiencia en programación, como C++, Perl,
-Python, R, etc.
-Gibas & Jambeck. 2001. Developing. Bioinformatics computer skills (actualizado con lenguajes modernos)
- </PAGE>
-<PAGE 5> Biólogo Molecular: Clonar y secuenciar un gen
-desconocido.
-- Biólogo Computacional: Identificar un gen desconocido.
-- Bioquímico: Conocer la especificidad del sustrato.
-- Biólogo Celular: Localización intracelular y sus cascadas
-de interacción.
-- Genetista: La ruta que éste afecta.
-- Fisiólogo: El órgano que éste afecta.
-- Bioinformático: Crear algoritmos y bases de datos que
-puedan integrar parcial o  totalmente toda esta información, incluyendo IA para predicciones.
-La función de los genes es entendida
-en Biología a varios niveles
- </PAGE>
-<PAGE 6> Historia
-de la Biología Molecular
- </PAGE>
-<PAGE 7> Fases de la historia
-Moreno & Vélez, 2021 (actualizado 2025)
-Fase 1: La genética:
-• 1865 – 1930. Mendel y sus leyes.
-• 1865 – 1952. La búsqueda del gen y la sustancia
-hereditaria.
-Fase 2: La biología molecular:
-• 1953 – 1966. La doble hélice y el código genético.
-• 1967 – 1989. La ingeniería genética y la reacción
-en cadena de la polimerasa.
-Fase 3: La genómica - Bioinformática:
-• 1990 – 2004. El proyecto genoma
-Fase 4: La era post-genómica:
-• 2005 – 2015. Ciencias ómicas y multi-ómicas
-Fase 5: Era de la biología impulsada por IA y sintética:
-• 2016 – Presente. Edición génica, IA en biología, biología sintética y medicina de precisión
- </PAGE>
-<PAGE 8> 1865 – 1930. Mendel y sus leyes
-El nacimiento de la genética
-Gregor Mendel
-Moreno & Vélez, 2021 (corregido)
- </PAGE>
-<PAGE 9> Leyes de Mendel
-•1.ª Principio de la uniformidad
-de los híbridos de la primera
-generación filial
-•2.ª Principio de la segregación
-•3.ª Transmisión independiente
-de los alelos
-Cruce monohíbrido
-Cruce dihíbrido
- </PAGE>
-<PAGE 10> 1865 – 1952. La búsqueda del gen y la
-sustancia hereditaria
-Moreno & Vélez, 2021
-Friedrich Miescher
-Aisló por primera vez los ácidos nucleicos
-Richard Altmann: acuñó el
-término "ácido nucleico" en
-, reemplazando el término
-"nucleína" de Friedrich Miescher
-cuando se demostró que la
-nucleína era ácida.
-Albrecht Kossel: describe sus
-componentes, distinguiendo
-entre adenina, citosina, guanina,
-timina y uracilo. Kossel
-estableció las bases que
-condujeron a esclarecer la
-estructura del ADN. (PN 1910)
- </PAGE>
-<PAGE 11> 1900 – 1952. La búsqueda del gen y
-la sustancia hereditaria
-El papel jugado por los cromosomas
-en la herencia
-Thomas H. Morgan
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 12> Cruces y recombinación durante la meiósis
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 13> La física: las propiedades cuánticas y
-estadísticas de electrones y fotones
-Congreso de Solvay – 1927
-Moreno & Vélez, 2021
-.Peter Debye
-.Irving Langmuir
-.Martin Knudsen
-.Auguste Piccard
-.Max Planck
-.William Lawrence Bragg
-.Émile Henriot
-.Paul Ehrenfest
-.Marie Curie
-.Hendrik Anthony Kramers
-.Édouard Herzen
-.Hendrik Antoon Lorentz
-.Théophile de Donder
-.Paul Adrien Maurice Dirac
-.Albert Einstein
-.Erwin Schrödinger
-.Arthur Holly Compton
-.Jules-Émile Verschaffelt
-.Paul Langevin
-.Louis-Victor de Broglie
-.Charles-Eugène Guye
-.Wolfgang Pauli
-.Werner Heisenberg
-.Max Born
-.Charles Thomson Rees Wilson
-.Ralph Howard Fowler
-.Léon Brillouin
-.Niels Bohr
-.Owen Willans Richardson
- </PAGE>
-<PAGE 14> La física: las propiedades estadísticas
-esperadas para el cromosoma y el gen
-(1932 – 1944)
-Max Delbrück
-Francis H. C. Crick
-Erwin Schrödinger
-Qué es la vida?
-Niels Bohr
-Congreso Internacional de Luminoterapia en
-Copenhague, Dinamarca
-Moreno & Vélez, 2021
-Claude Shannon
-John von
-Neumann
- </PAGE>
-<PAGE 15> El grupo del fago
-(1935 – 1952)
-Max Delbrück
-Salvador Luria
-Moreno & Vélez, 2021
-Alfred D. Hershey
- </PAGE>
-<PAGE 16> El experimento de la “licuadora”
-El grupo del fago
-Moreno & Vélez, 2021
-Fago infecta la
-bacteria
-Los fagos son
-removidos de las
-células en la
-licuadora
-Las células y los
-fagos  son separados
-por centrifugación
-Cápside de proteínas
-marcada con S
-No se detecto S
-en las células
-S detectado en
-el sobrenadante
-ADN  marcado
-con P
-P es detectado
-en las células
-Ningún P es
-detectado en el
-sobrenadante
- </PAGE>
-<PAGE 17> El neumococo transformante
-(1928)
-El experimento de Frederick Griffith
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 18> El neumococo transformante
-(1934 – 1944)
-Moreno & Vélez, 2021
-Oswald T. Avery
-Maclyn McCarty
-Colin M. MacLeod
- </PAGE>
-<PAGE 19> Un gen ….una enzima
-(1945 – 1955)
-George Beadle
-Edward Tatum
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 20> La genética de la resistencia bacteriana
-(1945 – 1956)
-Joshua Lederberg
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 21> La composición de los ácidos nucleicos
-(1945 – 1953)
-Erwin Chargaff
-[A] = [T]
-[G] = [C]
-Pu/Pi = 1.0
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 22> Composición de bases en moles por ciento
-Relación de bases
-Relación de
-asimetría
-A
-G
-C
-T
-A/T
-G/C
-Pu/Pi
-A+T/G+C
-Animales
-Hombre
-Cordero
-Salmón
-,9
-,3
-,7
-,9
-,4
-,8
-,8
-,4
-,4
-,3
-,1
-,05
-,03
-,02
-,02
-,02
-,04
-,03
-,02
-,52
-,36
-,43
-Plantas
-Gérmen de trigo
-Zanahoria
-,3
-,7
-,7
-,1
-,8
-,2
-,1
-,9
-,01
-,99
-,99
-,19
-,16
-Hongos
-Aspergillus niger
-Levadura
-,3
-,1
-,7
-,1
-,9
-,9
-,95
-,09
-,79
-Bacterias
-E. coli
-Sarcina lutea
-,7
-,4
-,1
-,7
-,1
-,6
-,4
-,04
-,08
-,01
-,03
-,04
-,93
-,35
-Fagos
-T7
-lambda
-,3
-,6
-,2
-,9
-,92
-,05
-,08
-,79
- </PAGE>
-<PAGE 23> La cristalografía
-y la estructura molecular de las proteínas
-Frederick Sanger
-Christian Anfinsen
-John Kendrew
-Linus C. Pauling
-Max Perutz
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 24> 1953 – 1966. La doble hélice
-y el código genético
-La estructura molecular del ADN (1952 – 1953):
-el nacimiento de la biología molecular
-Maurice
-Wilkins
-James
-Watson
-Moreno & Vélez, 2021
-Rosalind
-Franklin
-Francis
-Crick
- </PAGE>
-<PAGE 25>  </PAGE>
-<PAGE 26> Biología
-Molecular
----
-Genética
-Bioquímica
-Biología celular
-Watson, Crick, Wilkins
-y Franklin
-proponen la estructura
-molecular del ADN
- </PAGE>
-<PAGE 27> El dogma central de la
-Biología Molecular
-(1953 – 1956)
-Francis Crick
-DNA
-RNA
-Proteína
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 28> Los mecanismos en la síntesis biológica
-del ARN y el ADN (1956 – 1960)
-Arthur Kornberg
-Severo Ochoa
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 29> El DNA se replica de manera semiconservativa
-(1958)
-Experimento de Meselson & Stahl
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 30> Elucidación del código genético
-y su función en la síntesis de proteínas
-(1960 – 1966)
-Robert W. Holley
-Har Gobind Khorana
-Marshall W. Nirenberg
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 31> El código genético
-y su función en la síntesis de proteínas
-(1960 – 1966)
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 32> t-RNA
-Ala
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 33> La síntesis de Proteínas
- </PAGE>
-<PAGE 34> El control genético de la síntesis
-de enzimas y virus (1958 – 1964)
-François Jacob       André Lwoff
-Jacques Monod
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 35> El control genético:
-inducción del operon lac
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 36> 1967 – 1989. La ingeniería genética
-y la reacción en cadena de la polimerasa
-El nacimiento del ADN-Recombinante
-Hamilton O. Smith
-Paul Berg
-Werner Arber
-Daniel Nathans
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 37>  </PAGE>
-<PAGE 38> El secuenciamiento de los ácidos nucleicos
-(1960 – 1977)
-Frederick Sanger
-Walter Gilbert
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 39> La reacción en  cadena de la
-polimerasa o PCR  (1983)
-Tiempo (min)
-Temp. (oC)
-Denaturación
-Un ciclo de
-Polimerización
-Hibridización
-Moreno & Vélez, 2021
-Kary B. Mullis
- </PAGE>
-<PAGE 40> La mutagénesis dirigida
-Moreno & Vélez, 2021
-Michael Smith
- </PAGE>
-<PAGE 41> La microscopía electrónica cristalográfica:
-elucidación de complejos DNA-proteínas
-(1973 – 1980)
-Aaron Klug
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 42> La estructura molecular del Ribosoma
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 43> Virus tumorales
-y el material genético de la célula
-(1965 – 1973)
-David Baltimore
-Renato Dulbecco
-Howard M. Temin
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 44> El dogma central de la Biología Molecular
-revisado (1972)
-DNA
-Francis Crick
-RNA
-Proteína
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 45> El dogma central dentro de la célula
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 46> Orígen celular de los oncogenes
-retrovirales (HIV)
-(1977 – 1983)
-J. Michael Bishop
- Harold E. Varmus
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 47> El RNA catalítico y los elementos móviles
-(1970 – 1977)
-Sidney Altman      Thomas R. Cech
-Barbara McClintock
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 48> El RNA catalítico (1970 – 1977)
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 49> La redefinición del concepto del gen:
-los genes interrumpidos
-(1975 – 1977)
-Richard J. Roberts
-y
-Phillip A.
-Sharp
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 50> Exón 1
-Exón 2
-Exón 3
-Intrón 1
-Intrón 2
-Procesamiento del gen humano G0S19 (MIP1-alpha/CCL3)
-para formar el RNAm, parte del cual es luego traducido
-para formar la proteína quimioquina cuyo receptor
-(CCR5) es también un co-receptor HIV.
-Procesamiento del RNA heteronuclear o primario
-hnRNA
- </PAGE>
-<PAGE 51> Susumu Tonegawa
-El Orígen de la
-diversidad
-de los
-anticuerpos
-(1977-1983)
- </PAGE>
-<PAGE 52> Las proteínas tienen señales intrínsecas que
-gobiernan su transporte, localización
-y comunicación dentro de la célula
-(1979 – 1995)
-Günter Blobel
-Moreno & Vélez, 2021
- </PAGE>
-<PAGE 53> Edward B. Lewis
-Un gen codifica una forma
-en el cuerpo: el control genético
-del desarrollo embrionario en
-Drosophila (1995)
-Eric F. Wieschaus
-Christiane Nüsslein-Volhard
- </PAGE>
-<PAGE 54> R. Timothy Hunt
-El Control del ciclo celular
-(2001)
- </PAGE>
-<PAGE 55> Leland H. Hartwell
-El Control del ciclo celular
-(2001)
-Paul M. Nurse
- </PAGE>
-<PAGE 56> Sydney Brenner
-H. Robert Horvitz
-John E. Sulston
-La regulación genética  del
-desarrollo de los órganos
-y la muerte celular
-programada (2002)
- </PAGE>
-<PAGE 57> Aplicaciones de las técnicas de ADN-Recombinante y
-de ingeniería genética en todas las disciplinas de las
-ciencias de la vida
-• Agricultura: mejoramiento de cosechas, control de plagas.
-• Antropología: rastreo de haplotipos, movimientos migratorios.
-• Biología celular: metabolismo, división celular, diferenciación
-celular, morfogénesis, envejecimiento celular.
-• Cuestiones legales: perfiles de DNA (“fingerprinting”).
-• Filogenía y sistemática.
-• Medicina: diagnóstico y tratamiento de enfermedades, terapia génica.
-• Medio ambiente: bioindicadores de fuentes contaminantes.
-• Parasitología: aislamiento de genes “blanco” para control.
-• Protección de la vida silvestre mediante rastreo de perfiles DNA
-• Biotecnologías.
-• Organismos transgénicos, edición génica con CRISPR,…….etc.
-•M
-oren
-o
-&
-V
-él
-ez
-, 2021 (actualizado)
- </PAGE>
-<PAGE 58> La biología del desarrollo busca primero un gen para
-especificar una forma en el embrión. La biología celular busca un
-gen que especifique un elemento estructural. La medicina busca
-genes para producir proteínas del cuerpo o trazar las causas de
-las enfermedades. Las cuestiones filogenéticas, desde el origen de
-la
-vida hasta el origen de las especies son todas trazadas por
-patrones de moléculas de ADN. La ecología caracteriza las
-poblaciones naturales por amplificación de ADN: los habitats
-sociales de los animales y las migraciones de las poblaciones
-humanas se conducen sobre patrones de ADN. Las cuestiones
-legales de vida o muerte pueden abordarse sobre patrones de
-restricción de ADN. Y ahora, el proyecto genoma contempla
-descubrir los patrones de ADN completos y listar cada uno de los
-genes que caracterizan todas las especies modelo que los biólogos
-estudian, incluida la nuestra (Gilbert, W. 1991). Hoy, con IA, predecimos estructuras y funciones.
-La biología molecular hace 30 años (actualizado)
- </PAGE>
-<PAGE 59> El  Proyecto genoma  y el nacimiento
-de la Genómica – Bioinformática
-(1990 – 2001 – Presente)
-Moreno & Vélez, 2021
-• El proyecto oficial y público
-GenBank, EMBL y DDBJ
-Francis Collins
-• El proyecto privado
-TIGR & Celera Genomics
-Craig Venter
-.176 novelas de
-años de soledad
- </PAGE>
-<PAGE 60> Bioinformática
-– 1990 - Presente
-Moreno & Vélez, 2021
-. La pregunta
-. La base de datos
-. El enfoque y la
-herramienta (incluyendo IA)
-. La interpretación
-. La comunicación
-(publicación)
- </PAGE>
-<PAGE 61> Con el proyecto genoma aparecieron:
-Moreno & Vélez, 2021
-• Nuevas esperanzas para la humanidad
-• Nuevas alianzas
-• Nuevas concepciones
-• Nuevas tecnologías (NGS, single-cell)
-• Nuevas empresas biotecnológicas
-• Abundante información
-• Nuevas ambiciones humanas
-• Y mucha inversión económica
- </PAGE>
-<PAGE 62> El dogma central de la biología molecular
-en la era post-genómica
-DNA1
-RNA11
-Proteína111
-Proteína1111
-Proteína1112
-RNA12
-Proteína121
-RNA13
-Proteína131
-RNA1n
-Proteína1n+n
-Moreno & Vélez, 2021
-Genoma
-Transcriptoma
-Proteoma
-(Extendido a multi-ómicas: epigenoma, metaboloma, etc.)
- </PAGE>
-<PAGE 63> Moreno & Vélez, 2021 (actualizado 2025)
-La Post-Genómica: Ciencias ómicas
-  - Presente
-- 2009
-- 1995
-Fluxómica
-Interactómica
-Single-cell omics
-Spatial omics
- </PAGE>
-<PAGE 64> Moreno & Vélez, 2021
-Perfiles Multi-ómicos
-Medicina de precisión 4P:
-Prevención
-Predicción
-Participativa
-Personalizada
- </PAGE>
-<PAGE 65> Moreno & Vélez, 2021
-Metagenómica
-En metagenómica, los materiales genéticos
-(ADN, C) se extraen directamente de
-muestras tomadas del medio ambiente (por
-ejemplo, suelo, agua de mar, intestino
-humano, A) después del filtrado (B), y se
-secuencian (E) después de la multiplicación
-por clonación (D) en un enfoque llamado
-secuenciación de escopeta. Estas
-secuencias cortas se pueden volver a juntar
-utilizando métodos de ensamblaje (F) para
-deducir los genomas individuales o partes
-de genomas que constituyen la muestra
-ambiental original. Esta información se
-puede utilizar para estudiar la diversidad de
-especies y el potencial funcional de la
-comunidad microbiana del medio ambiente.
-(Actualizado: avances en metagenómica con NGS y AI para análisis)
- </PAGE>
-<PAGE 66> Microbioma humano: Los microbios son parte del ser humano desde la etapa
-inicial de desarrollo y juegan un papel importante en el funcionamiento del
-cuerpo humano. El microbioma humano está compuesto por virus, bacterias y
-hongos que residen en comunidades dentro y fuera del cuerpo.
-(Actualizado: Proyectos como Human Microbiome Project fase 2, enlaces con enfermedades)
- </PAGE>
-<PAGE 67> Leroy Hood
-La biología de sistemas
-(2000 – Presente)
-George Lake
-Moreno & Vélez, 2021
-Uno de los desafíos de la biología de sistemas y la genómica
-funcional es integrar la información genómica, transcriptómica,
-proteómica y metabolómica para proporcionar una mejor
-comprensión de la biología celular
-¿Es posible producir
-una descripción
-matemática completa de
-sistemas biológicos
-complejos? (Con AI, sí, ej. modelos predictivos)
- </PAGE>
-<PAGE 68> La biología de sistemas es un enfoque en la investigación
-biomédica para comprender el panorama general, ya sea a
-nivel del organismo, tejido o célula, uniendo sus piezas. Está
-en marcado contraste con décadas de biología reduccionista,
-que implica desmontar las piezas.
-(Actualizado: integración con multi-omics y AI)
- </PAGE>
-<PAGE 69> Análisis de Redes Biológicas
-Some of the most common types of
-biological networks are:
-.Protein-protein interaction networks
-.Metabolic networks
-.Genetic interaction networks
-.Gene / transcriptional regulatory
-networks
-.Cell signalling networks
-Esta subdisciplina se enfoca en el análisis de las interacciones entre
-moléculas biológicas, incluyendo proteínas, metabolitos y genes, para
-entender cómo funcionan los sistemas biológicos (Actualizado con graph neural networks via AI)
- </PAGE>
-<PAGE 70> Modelamiento molecular
-Esta subdisciplina se enfoca en la simulación y modelado de las
-estructuras moleculares de los organismos, incluyendo proteínas,
-ácidos nucleicos y otros componentes celulares.
-Aplicaciones. Una gran cantidad de modelos moleculares de campos de fuerza
-están disponibles hoy en día en las bases de datos. Los tipos de actividad
-biológica que se han investigado utilizando modelos moleculares incluyen
-plegamiento de proteínas, catálisis enzimática, estabilidad de proteínas,
-cambios conformacionales asociados con la función biomolecular y
-reconocimiento molecular de proteínas, ADN y complejos de membrana.
-(Actualizado: AlphaFold para plegamiento de proteínas)
- </PAGE>
-<PAGE 71> Inteligencia artificial aplicada a la
-Bioinformática
-La IA se utiliza en la bioinformática, para analizar y comprender los datos
-biológicos complejos.
-. Análisis de secuencias de ADN: La IA se utiliza para analizar grandes
-cantidades de datos de secuencias de ADN. Los algoritmos de aprendizaje
-automático y la minería de datos se utilizan para identificar patrones y
-características en las secuencias de ADN, lo que puede ayudar a los
-investigadores a comprender mejor la estructura y la función del ADN.
-. Modelado de proteínas: La IA se utiliza para modelar la estructura de las
-proteínas y predecir su función. Los algoritmos de aprendizaje automático se
-utilizan para analizar los datos de secuencias de proteínas y crear modelos
-tridimensionales precisos de las proteínas (ej. AlphaFold 2021).
-. Análisis de imágenes médicas: La IA se utiliza para analizar imágenes
-médicas, como tomografías computarizadas (TC) y resonancias magnéticas
-(RM). Los algoritmos de aprendizaje automático se utilizan para identificar
-patrones y características en las imágenes, lo que puede ayudar a los médicos a
-detectar y diagnosticar enfermedades.
- </PAGE>
-<PAGE 72> 4. Diagnóstico y tratamiento de enfermedades: La IA se utiliza para desarrollar
-herramientas de diagnóstico y tratamiento más precisas y efectivas para una
-variedad de enfermedades, como el cáncer. Los algoritmos de aprendizaje
-automático se utilizan para analizar datos de pacientes y crear modelos
-predictivos que pueden ayudar a los médicos a tomar decisiones informadas
-sobre el tratamiento.
-. Descubrimiento de fármacos: La IA se utiliza para acelerar el proceso de
-descubrimiento de fármacos al identificar compuestos prometedores para su
-desarrollo. Los algoritmos de aprendizaje automático se utilizan para analizar
-grandes conjuntos de datos y crear modelos predictivos que pueden predecir
-la efectividad y seguridad de los compuestos candidatos.
-. Integración multi-ómica: IA para fusionar datos de genómica, proteómica, etc.
-Inteligencia artificial aplicada a la
-Bioinformática (actualizado con desarrollos 2010-2025)
- </PAGE>
-<PAGE 73> Sociedades en Bioinformática
-e Inteligencia artificial (actualizado: ISCB, AMIA, etc.)
- </PAGE>
-<PAGE 74> En resumen
-Moreno & Vélez, 2021 (actualizado 2025)
-• Biología
-• Genética
-Siglos XVI-XVII
-/1900
-• Biología molecular
-• DNA–Recombinante
-• Bioinformática
-• Genómica
-estructural
-funcional
-/1953
-• Ciencias ómicas                                   2005
-• Edición génica (CRISPR)                          2012
-• Células iPS                                      2006
-• AlphaFold y IA en biología                       2021
-• Vacunas mRNA                                     2020
-• Paleogenómica                                    2022
- </PAGE>
-<PAGE 75> Moreno & Vélez, 2021 (actualizado 2025)
-…Y la historia continua …
- </PAGE>
-<PAGE 76> Avances post-2002: Nobel en Fisiología o Medicina relevantes
-: Canales iónicos y de agua (Química, pero relacionado)
-: Receptores olfatorios
-: Interferencia de RNA (Andrew Fire, Craig Mello)
-: Targeting génico en ratones (Mario Capecchi, Martin Evans, Oliver Smithies)
-: Telómeros y telomerasa (Elizabeth Blackburn, Carol Greider, Jack Szostak)
-: Células iPS (Shinya Yamanaka, John Gurdon)
-: Tráfico vesicular (James Rothman, Randy Schekman, Thomas Südhof)
-: Autofagia (Yoshinori Ohsumi)
-: Ritmo circadiano (Jeffrey Hall, Michael Rosbash, Michael Young)
-: Sensado de oxígeno (William Kaelin, Peter Ratcliffe, Gregg Semenza)
-: Paleogenómica (Svante Pääbo)
-: Vacunas mRNA (Katalin Karikó, Drew Weissman)
-: microRNA (Victor Ambros, Gary Ruvkun)
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-<PAGE 77> Avances post-2002: Nobel en Química relevantes
-: Canales en membranas (Peter Agre, Roderick MacKinnon)
-: Degradación proteica por ubiquitina (Aaron Ciechanover, Avram Hershko, Irwin Rose)
-: Transcripción eucariota (Roger Kornberg)
-: GFP (Osamu Shimomura, Martin Chalfie, Roger Tsien)
-: Estructura del ribosoma (Venkatraman Ramakrishnan, Thomas Steitz, Ada Yonath)
-: Receptores acoplados a proteína G (Robert Lefkowitz, Brian Kobilka)
-: Modelos multiescala para sistemas químicos (Martin Karplus, Michael Levitt, Arieh Warshel)
-: Microscopía de super-resolución (Eric Betzig, Stefan Hell, William Moerner)
-: Reparación del ADN (Tomas Lindahl, Paul Modrich, Aziz Sancar)
-: Crio-microscopía electrónica (Jacques Dubochet, Joachim Frank, Richard Henderson)
-: Evolución dirigida y phage display (Frances Arnold, George Smith, Gregory Winter)
-: CRISPR-Cas9 (Emmanuelle Charpentier, Jennifer Doudna)
-: Química click y bioortogonal (Carolyn Bertozzi, Morten Meldal, K. Barry Sharpless)
-: Diseño de proteínas computacional y predicción de estructuras (David Baker, Demis Hassabis, John Jumper)
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-<PAGE 78> Descubrimientos clave post-2002 en Biología Molecular
-- 2006: Descubrimiento de células madre pluripotentes inducidas (iPS) por Shinya Yamanaka.
-- 2012: Desarrollo de CRISPR-Cas9 como herramienta de edición génica por Jennifer Doudna y Emmanuelle Charpentier.
-- 2013: Avances en microscopía de super-resolución y crio-EM para estructuras moleculares.
-- 2015: Mecanismos de reparación del ADN.
-- 2020: Desarrollo rápido de vacunas mRNA contra COVID-19.
-- 2021: AlphaFold de DeepMind revoluciona la predicción de estructuras proteicas.
-- 2022: Secuenciación de genomas antiguos y paleogenómica.
-- 2024: Reconocimiento de microRNA en regulación génica.
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-<PAGE 79> Avances en Genómica y Ómicas post-2005
-- Next-Generation Sequencing (NGS): Reducción de costos y aumento de velocidad (Illumina, PacBio).
-- Single-cell omics: Análisis a nivel de célula individual (scRNA-seq, 2010s).
-- Spatial omics: Mapeo espacial de transcripciones (Spatial Transcriptomics, 2016; Visium).
-- Multi-omics integration: Combinación de genómica, transcriptómica, proteómica, metabolómica con AI.
-- Epigenomics: Proyectos como ENCODE (2003-2022) para mapa funcional del genoma.
-- Metagenomics: Human Microbiome Project (2007-), estudios de microbiomas en salud.
-- Fluxomics y Interactomics: Análisis de flujos metabólicos y interacciones.
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-<PAGE 80> Aplicaciones de IA en Bioinformática (2010-2025)
-- 2010s: Machine learning para análisis de secuencias y predicción de funciones.
-- 2018: Deep learning en genómica (e.g., DeepVariant para llamadas de variantes).
-- 2021: AlphaFold resuelve el problema de plegamiento de proteínas.
-- 2022: Modelos de lenguaje grandes para biología (e.g., ESM para proteínas).
-- 2023-2025: IA en descubrimiento de fármacos, diseño de proteínas de novo (David Baker).
-- Integración multi-ómica con graph neural networks.
-- AI para medicina de precisión: Predicción de respuestas a tratamientos.
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-<PAGE 81> Pioneros clave post-2002
-- Jennifer Doudna y Emmanuelle Charpentier: CRISPR (2020 Nobel Química).
-- Shinya Yamanaka: iPS cells (2012 Nobel Medicina).
-- Demis Hassabis y John Jumper: AlphaFold (2024 Nobel Química).
-- David Baker: Diseño computacional de proteínas (2024 Nobel Química).
-- Svante Pääbo: Paleogenómica (2022 Nobel Medicina).
-- Katalin Karikó y Drew Weissman: Tecnología mRNA (2023 Nobel Medicina).
-- Yoshinori Ohsumi: Autofagia (2016 Nobel Medicina).
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-<PAGE 82> Impacto en Medicina
-- Terapia génica: Aprobaciones FDA para enfermedades raras (e.g., Zolgensma 2019).
-- Inmunoterapia: CAR-T cells para cáncer (2017).
-- Medicina de precisión: Oncología guiada por genómica (e.g., targeted therapies).
-- Vacunas mRNA: COVID-19 (2020), potencial para otras enfermedades.
-- Diagnóstico con AI: Análisis de imágenes y genómica para detección temprana.
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-<PAGE 83> Impacto en Química y Bioquímica
-- Química bioortogonal: Reacciones en sistemas vivos (Bertozzi, 2022).
-- Máquinas moleculares: Motores nanométricos (2016 Nobel).
-- Evolución dirigida: Ingeniería de enzimas (Arnold, 2018).
-- Quantum dots en biología: Imagen y sensores (2023 Nobel).
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-<PAGE 84> Futuro: Biología Sintética y Ética
-- Biología sintética: Creación de organismos artificiales (e.g., minimal genome por Venter, 2010).
-- Ética en edición génica: Debates sobre edición germinal (He Jiankui, 2018).
-- AI ética en bio: Bias en datos, privacidad en genómica.
-- Sostenibilidad: Biotecnología para cambio climático (e.g., biofábricas).
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-<PAGE 85> Referencias
-Moreno & Vélez, 2021 (actualizado 2025)
-) Academia Nobel. Estocolmo, Suecia. http://www.nobel.se
-) Burke, A. 2000. Genome technology. Sep. 20-26.
-) Gribben, J. 1986. En busca de la doble hélice. Enciclopedia
-científica Salvat. España.
-) La base molecular de la vida. 1972. Edt. Interamericana.
-) Schrödinger. E. 1986. Qué es la vida?. Edt. Tusquest.
-) Watson, JD. 1972. La doble hélice. Plaza y Janes. Bogotá.
-) Moreno, PA, Vélez, PE, Burgos JD, 2009. Biología
-Molecular, Genómica y PostGenómica. Edt. UniCauca.
-) Bolaños, I, Vélez, P, Moreno PA, 2020. Metagenómica:
-Pioneros, principios y aplicaciones. Edt. UniCauca.
-) Moreno PA, Vélez PE, 2023. Bioinformática para ciencias
-de la vida e ingenierías. Edt. UniValle.
-) NobelPrize.org (actualizado a 2024)
-) Nature Reviews Genomics (varios artículos 2005-2025)
-) Science Magazine: Advances in AI and Omics
- </PAGE>
-</DOCUMENT>

Bioinformatics Research Group at Universidad del Valle

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